疆电外送通道不畅
2010年，新疆与西北750kV联网工程正式投运，结束了新疆电网孤网运行历史。目前，经过五年多的发展，已初步形成以哈—郑±800kV特高压直流通道为主、4回750kV交流通道配合的外送网架结构。但是,随着新增装机容量的扩大，现有的外送通道已经不能满足疆电外送的需求。在尚未推行RPS及增加外送通道的前提下，对外输电仍存在很大问题。在2015年上半年，仅光伏和风电的弃电量总规模达35.11亿kW/h，而同期疆电外送总规模为146亿kW/h，仅此两项约占外送电量的24.05%。
从自治区发改委公布的数据显示，准东—华东(皖南)±1100kV特高压直流输电工程已于2015年7月正式进入建设准备阶段，这是新疆实施的第二条特高压直流外送输电通道。该工程额定输送功率1200万千瓦，目前是全世界规划输电容量最大、输电距离最长的首个正负1100kV特高压直流输电工程。预计在“十三五”后期，投入运营。在今后一段时间内，解决“电力消纳”问题仍是一个难题。
政策法规尚待完善
为鼓励光伏、风电的发展，新疆政府出台和制定了相关政策和措施，导致大量企业涌入新疆，行业竞争热化。在此背景下，各县、市、地区及新疆生产建设兵团各师、团在引进企业过程中，明目多样。比如，按照项目一般建设流程，在取得相关文件的核准之后，才能开工建设。但是，地方政府盲目追求GDP，催促企业在不完全具备条件下入场施工。这对企业而言，大大的增加了项目投资的风险性。既有可能导致电厂建成难以并网，致使大批资金压制，影响公司整体运营，又有可能承担着其它的风险。
另一方面，政府补贴资金不到位。据国家能源局统计，截至2014年年底，全国可再生能源补贴资金缺口累计已超过140亿元。一般而言，从电厂开始并网发电到审批上报，从审批结束到补贴发放时间，需花一年半的时间。在资金压力与利息成本上，加之融资渠道结构单一，这种滞后性给投资者带来巨大的挑战。从而增加企业的经营压力，使部分企业陷于进退两难的尴尬境地。
开发规划缺乏协调
目前，新疆政府、国网新疆电力公司都在编制开发规划，其开发规模、布局、时序等方面存在较大差异。地方政府依照当地风能资源情况确定开发规模和建设时序，未考虑电力系统的电源结构、消纳市场、电网输电能力等因素。同时，地方政府和电网企业之间就规划目标缺乏统一协调，造成风电开发规划与其他电源的建设规划、电网规划相互脱节，不能协调兼顾，也很大程度上影响合理有序开发和并网发电。比如，就风电而言，目前实行的5万千瓦风电项目由省（市）审批的规定，造成许多大风场被人为地割裂，致使一些设施重复建设，投资严重浪费。
