较高的制作成本
使用磷酸铁锂电芯的移动电源所提供的材料样本
由于磷酸铁锂正极中的材料物理性能和其他锂电池材料相差较大，粒度小，振实密度小等因素的影响，所以在制作工艺上的工艺要求较高，加上其标称电压为3.2V，低于普通3.7V的锂电池电压，所以在制造整个电池组成本和相关制造设备和工艺上的要求要高于其他锂电池。
除了以上介绍磷酸铁锂电池的三大弊端之后，还有一个潜在的问题在阻碍磷酸铁锂电池的发展，就是正极材料的专利纷争问题。让目前磷酸铁锂的整体成本要高于早已普及的钴酸锂和锰酸锂电池。不过值得欣慰的是，近期其专利问题已经得到缓解。
前景广阔
下表为磷酸铁锂电池和锰酸锂、钴酸锂电池的几个比较明显的数据对比，主要通过标称电压、充放电压范围、体积比能量等几大方面进行对比。
从上表中我们可以看出，磷酸铁锂、钴酸锂、锰酸锂三种使用不同正极材料的电池，虽然统称为锂离子电池，不过从其功能特性来看，还是存在较大差别的。
