(1)信息孤岛将成为智慧城市应用的桎梏
由于我国城市信息化是一个逐步完善的过程，在不同时期分散建设的系统，由于在运行环境、数据库系统、数据格式、业务流程定义等方面执行不同标准，导致系统无法信息共享和集成的根本原因。而且行业发展水平参差不齐，因此信息孤岛在我国是一个普遍问题。但随着智慧城市建设的深入开展，信息孤岛将成为大数据应用的桎梏，若不能解决信息孤岛问题，则智慧城市建设将变成一个个“行业示范应用”，无法真正全面推广。
(2)信息安全将成为智慧城市应用推广的突出问题
大数据时代，数据资产化成为趋势，企业内部运行数据和客户资料成为宝贵的数据资产，而且很多智慧城市应用涉及公民财产安全甚至国家安全，数据价值更高，因此信息安全问题成为大数据时代智慧城市建设首要难题。当前政府、企业、个人的数据安全意识也开始增强，2012年12月28日，全国人大常委会第三十次会议通过了《关于加强网络信息保护决定》，该决定将政府、企业、个人信息数据上升到极其重要的法律保护位置，同时对惩处威胁信息安全的行为提供了法律依据。但客观来看，我国信息安全技术水平相对国外先进水平差距依然较大，未来国家的扶持力度将会进一步加大，国内企业将面临更大发展机遇。
(3)智慧城市项目复杂度大，牵涉部门众多，协调非常困难
智慧城市项目的复杂程度主要体现在两方面：一方面是涉及到的政府部门和企业众多，如公安、行政、城管、卫生、路政等分属不同的行政部门，这给数据共享带来很大难度，未来视频数据在交通部、公安部、城管部门等多个部门共享，需要不同政府部门形成统一，如何让企业将数据贡献出来也需要相关政策来支持。另一方面是技术难度越来越大，综合了交通工程、信息工程、通信技术、控制工程、计算机技术等众多领域的成果，智慧城市系统需要把多个子系统进行集成，需要系统集成商有相关的平台及产品和工程资质。
